Po završetku škole prvo se zapošljava kao policajac, da bi 1985. godine došao u Specijalnu jedinicu gdje postaje komandir borbene jedinice sa činom kapetana. Paralelno sa ovim aktivnostima Vinko Šamrlić bio je istaknuti džudista sarajevskog džudo kluba Željezničar. Osvojio je brojne medalje te je postao reprezentativac BiH.
Osim što se radilo o vrhunskom sportisti i neustrašivom borcu, Vinka Šamarlića svi, a posebno oni koji su ga osobno poznavali, pamte kao izuzetnog čovjeka. O tome najbolje svjedoči slijedeća priča.
Početkom agresije na BiH on je već imao osvojenu olimpijsku normu što je značilo da je ispunjavao osnovnu predispoziciju za odlazak na Olimpijske igre koje su se 1992. godine održavale u Barceloni. Imao je i saglasnost vojnih vlasti da se umjesto borbi na prvim linijama obrane Sarajeva može posvetiti pripremama za olimpijske igre. Unatoč svemu on se odlučio ostaiti sa svoji suborcima iz Specijalne jedinice MUP BiH – Odred Bosna. Borili su se na najkritičnijim mjestima, a ne bez razloga su još od prvih dana osvojili simpatije svih građana ulijevajući im sigurnost i nadu u pobjedu.
Poginuo je 08. juna 1992. godine, dan prije odlaska ekipe na Olimpijske igre u Barceloni poginuo je Vinko Šamarlić.
Posthumno je odlikovan i “Zlatnom policijskom zvijezdom”, “Medaljom za hrabrost” i “Ordenom zlatnog grba sa mačevima”. U sjećanju na njega jedna ulica u Sarajevu nosi njegovo ime, a svake godine u spomen na njega u Sarajevu se održava Memorijalni, internacionalni Judo turnir, podsjeća Historija.ba.
Delegacija Federalnog MUP-a i FUP-a u sastavu Jasminka Ademović, pomoćnica federalnog ministra unutrašnjih poslova i Emin Terzo, samostalni inspektor jučer su 8. juna uime ministra Rame Isaka i direktora Federalne uprave policije Vahidina Munjića minutom šutnje i polaganjem cvijeća na groblju “Lav” odali su počast Vinku Šamarliću povodom obilježavanja 33. godišnjice pogibije jednog od najvećih heroja Odbrambeno-oslobodilačkog rata 1992.-1995. godine.